Webinaire Section Microbiologie des Aliments par la Société Française de Microbiologie :
Les campylobacters, c’est mercredi 10 mai de 12h30 à 13h30
– Philippe Lehours : Epidémiologie des infections humaines à Campylobacters en France
– Jasmina Vidic : Sensitive detection of Campylobacter in chicken meat
– Rute Matos : A journey through the world of RNases in Campylobacter jejuni (intervention en anglais)
ONERBA_team, Observatoire National de l’Epidemiologie de la Résistance Bacterienne aux Antibiotiques.
« L’enquête nationale sur la résistance aux antibiotiques des bactéries à tropisme digestif : Salmonella, Campylobacter, Shigella et Yersinia spp. se clôture au 5 mai 2023, vous avez donc l’opportunité de vous associer aux 80 autres laboratoires hospitaliers et groupements privés ayant déjà fourni plus de 200 fichiers d’extractions.
N’oubliez pas de répondre au questionnaire associé.
Merci de votre participation
ONERBA_team (Observatoire National de l’Epidemiologie de la Résistance Bacterienne aux Antibiotiques)
Vous retrouverez cette enquête en PJ et sur notre site,
CONGRES ANNUEL DU GEFH – le 15 juin 2023 – Lille
Le Groupe d’Études Français des Helicobacters (GEFH, www.helicobacter.fr) organise son congrès annuel le jeudi 15 juin prochain à Lille.
Elle rassemblera microbiologistes, gastroentérologues, généralistes, pédiatres, pathologistes etc.. intéressés par les infections à H. pylori.
Nous vous invitons à vous y inscrire et à déposer, si vous le souhaitez, un résumé de vos travaux.
Cette journée est une occasion unique de discuter avec les principaux acteurs du domaine
Nous espérons vous y accueillir nombreux.
Cordialement
Philippe Lehours et E Bessède au nom de toute l’équipe du CNRCH et du GEFH.
-> Programme provisoire GEFH 15 juin 2023_V3. ppt
Nouvel article dans European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases – publication du 16 mars 2023
-> RIDA®GENE Helicobacter pylori PCR on the ELITe InGenius System
La détection par PCR de l’infection à Helicobacter pylori dans les biopsies gastriques permet la détection de cette bactérie et des mutations associée à la résistance aux macrolides.
Le but de cette étude était d’évaluer les performances de la PCR RIDA®GENE H. pylori (r-Biopharm) sur le système ELITe InGenius (Elitech).
Deux cents biopsies gastriques ont été traitées. Ces biopsies ont été broyées dans un bouillon nutritif.
Deux cents microlitres de cette suspension ont été traités avec de la protéinase K, puis 200 µL du lysat ont été transférés dans un tube d’échantillon ELITe InGenius pour être analysés à l’aide des réactifs PCR RIDA®GENE H. pylori.
La PCR H. pylori maison du CNR a été utilisée comme référence.
La sensibilité de la PCR RIDA®GENE H. pylori avec ELITe InGenius était de 100%, la spécificité de 98 % (intervalle de confiance (IC) à 95 %, 95,3-100 %), la VPP de 98 % (IC 95 %, 95,3-100 %), et la VPN de 100 % pour la détection de H. pylori. Tous ces mêmes paramètres étaient de 100 % pour la catégorisation de la résistance aux macrolides.
L’adaptation des réactifs PCR RIDA®GENE H. pylori sur le système ELITe InGenius est validée avec succès. Cette PCR est facile à utiliser sur ce système.
Santé Publique France a mis en ligne le Bilan de surveillance année 2021 des Campylobacters.
A consulter sur leur site par le lien suivant ou à télécharger en fichier joint.
-> Bilan de surveillance 2021 des Campylobacters Santé Publique France
-> Bilan_surveillance_campylo_2021_VF
Nous vous informons du renouvellement de notre mission en tant que Centre National de Référence pour une période de 5 ans 2023-2027, selon le décret n°2022-1770 paru au Journal Officiel du 30 décembre 2022.
Arrêté 30 décembre 2022_fixant liste des CNR
Décrêt 30 décembre 2022_relatif aux CNR
-> Diaporama de l’infection à Hélicobacter pylori en France : données 2017-2021
Présentation lors du congrès de la RICAI décembre 2022. Cliquer sur le lien suivant : RICAI 2022 P Lehours
-> Étude rétrospective multicentrique sur Campylobacter spp. Bactériémie en France.
Cliquer sur le lien suivant : Bacteremia in France: The Campylobacteremia Study -Tinevez 2022
-> La nomenclature des actes de biologie médicale concernant H. pylori change !
La PCR H. pylori sur biopsie gastrique peut être cotée B100.
La culture de H. pylori est indiquée en cas d’échec de traitement d’éradication (B60 + B70 pour l’antibiogramme).
Le test respiratoire à l’urée marquée peut être prescrit en dépistage ou en contrôle d’éradication (B45).
La détection antigénique de H. pylori dans les selles peut être cotée B40, en dépistage ou en contrôle d’éradication.
Cf JO du 16/12/2022.
Journal Officiel 20221216_0291_0040-1
-> SFM, Campylobacter Release in december 2022, avec notre participation à l’écriture du livre sur trois chapitres.
Cliquer sur le lien suivant : https://www.sfm-microbiologie.org/boutique/campylobacter-2022/
-> Article du jle, Hépato-Gastro, 2022, Volume 29, Numéro 8 :
Exploration microbiologique de la sensibilité aux antibiotiques de Helicobacter pylori. Pr Philippe Lehours.
Résumé : L’étude de la sensibilité de Helicobacter pylori aux antibiotiques repose sur l’isolement par culture de la bactérie à partir de biopsies gastriques. Les antibiogrammes sont réalisés par détermination des concentrations minimales inhibitrices en testant au minimum la clarithromycine et la lévofloxacine.
L’alternative à la culture est de chercher au minimum par PCR les mutations associées à la résistance aux macrolides. Les PCR sur échantillons de selles ne sont pas encore au point.
Pour sa lecture intégrale : –> explorations microbiologiques de la sensibilité aux antibiotiques de Helicobacter pylori – jle – Hepato-gastro oncologie – PL
________
-> Les demandes de sérologie Campylobacter jejuni doivent être accompagnées d’une fiche de renseignements cliniques téléchargeable sur notre site internet.
Pour télécharger ce document, vous rendre dans l’onglet :
« Catalogue des actes » -> « campylobacter (sérologie) » ->« formulaire requis »
En l’absence de cette feuille, la sérologie ne sera pas effectuée.
Merci pour votre collaboration.
________
-> « Nouvelles valeurs moléculaires pour les tests de sensibilité aux antibiotiques pour Aliarcobacter butzleri » à lire dans notre onglet « Bilans et Publications » –
Molecular Cut-off Values for Aliarcobacter butzleri Susceptibility Testing
________
Les sociétés I2A et Biomérieux commercialisent des bandelettes contenant de l’amoxicilline + une concentration fixe d’acide clavulanique à 2mg/L.
Les valeurs de CMI obtenues sur la souche de CQ pour C. jejuni sont impactées.
Les bornes proposées dans les recommandations du CASFM ne sont plus valables pour cette nouvelle génération de bandelettes.
Ouvrir le lien suivant : CMI AUG comparaison Biomerieux I2A
________
Recommandations du CASFM 2022 pour Campylobacter et Helicobacter pylori
-> Vous pouvez télécharger le document dans l’onglet « FICHES TECHNIQUES et RECOMMANDATIONS »
_______
-Mme Fanny Chéreau, Santé Publique France : « Bilan 2017-2021 de l’épidémiologie des infections à Campylobacters en France ».
cliquer sur le lien ci-après pour la lecture du document -> Présentation de F Chereau Santé Publique France
-Mme Lucie Bruhl, ingénieur au CNRCH: « Automatisation sur BDMAX et Ingenius d’une PCR commerciale pour la détection de Helicobacter pylori ».
cliquer sur le lien ci-après pour la lecture du document -> Lucie B séminaire CNR juin 2022
________
CNR des Campylobacters & Hélicobacters : Préparation des antibiogrammes campylobacter – ensemencement Helicobacter pylori
Photos : Guillaume Ferran – CHU Bordeaux
Nomination du CNRCH 2023-2027 :
Le Laboratoire de Bactériologie de l’Hôpital des Enfants de Bordeaux a été l’un des premiers en France à s’intéresser aux Campylobacters en 1979. Durant les années 80, nous avons mené plusieurs études sur le rôle des Campylobacters dans les diarrhées de l’enfant dans les pays en développement, soutenues par : l’OMS (Vietnam), la Communauté Européenne (Burkina Faso) et le Ministère français des Affaires Etrangères (Algérie).
En France, nous avons mis en place un réseau hospitalier de surveillance des infections à Campylobacter avec l’aide du Groupe d’Etudes Epidémiologiques et Prophylactiques (GEEP). Ce réseau soutenu par le Ministère de la Santé dès 1986 a permis d’obtenir les premières données épidémiologiques sur cette infection dans notre pays, et notre laboratoire est devenu Centre National de Référence en 1993, renouvelé en 1998, 2002 et 2006. En 2002, le système de surveillance a été étendu aux laboratoires de ville.
Helicobacter pylori a été découvert en 1982, et classé initialement dans le genre Campylobacter. Pour cette raison, nous avons été amenés à étudier cette bactérie qui avait une niche écologique différente de celle des autres Campylobacters. C’est seulement en 1989 qu’un nouveau genre a été créé pour cette bactérie avec comme espèce principale H. pylori.
Le CNRCH a été créé en 1993 et est passé sous gestion du CHU de Bordeaux depuis 2017 pour la période 2017-2022.
Le mandat est renouvelé pour la période de 2023 à 2027, selon le décret n°2022-1770 paru au Journal Officiel du 30 décembre 2022.
Arrêté 30 décembre 2022_fixant liste des CNR
Décrêt 30 décembre 2022_relatif aux CNR
campylobacter, campylobacter, helicobacter, antibiotique, surveillance, traitements, épidémiologie, conseils, avis, antibiotiques, éradications, antibiotiques, conseil, centre, bordeaux,référence, souche, souches, campylobacter, helicobacter, avis, conseils, suivi, surveillance, équipe, CHU Bordeaux, campylobacter, hélicobacter, infection, infections, épidémiologie, conseils et traitement, antibiotique
campylobacter, helicobacter, reference, bordeaux, Bordeaux,cnr, france, antibiotiques, réseau, surveillance, souche, centre, campylobacter, hélicobacter, reference, bordeaux, cnr, france, réseau, surveillance, souche, centre, traitement, conseils, conseil, éradication, antibiotiques, analyse, résistance, épidémiologie, cnr, centre, bordeaux, conseils, traitement, campylobacter, bordeaux, équipe, surveillance, résistance, traitements analyses, laboratoire, antibiotiques, référence, surveillance, veille, analyse, ATB, réseau, antibiotiques, centre, traitement, conseils, avis, helicobacter, france, bordeaux, bordeaux, réseau, surveillance, traitement, infections, campylobacter, campylobacter, résistance, traitements, campylobacter, hélicobacter, bordeaux, centre, antibiotique,
