GEFH PARIS 2022

Le Groupe d’Etudes Français des Helicobacters organise le 10 juin 2022 son congrès annuel.

La réunion se tiendra à l’Institut Pasteur de Paris.

Le programme (ci-joint) sera articulé autour de conférences d’actualisation et de communications libres.

N’hésitez pas à vous inscrire.

Ne ratez pas une occasion de maintenir vos compétences sur Helicobacter pylori.

Très cordialement

P Lehours et E Bessède au nom des membres du GEFH

Programme provisoire GEFH 10 juin 2022_V4. ppt

 

 

CNR des Campylobacters & Hélicobacters : Préparation des antibiogrammes campylobacter – ensemencement Helicobacter pylori

 Photos : Guillaume Ferran – CHU Bordeaux

 

 

Répartition par départements des souches campylobacters reçues au CNRCH en 2021 et déclarées en ligne par le réseau Campy-internet.

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

 

Représentation du génome de Helicobacter pylori sous forme d’un réseau de gènes.

Construit à partir de plus de 1000 souches, cet arbre contient plus de 20000 arêtes et des milliers de gènes.

Quentin Jehanne.

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

 

Webinars hebdomadaires de Microbiologie Clinique

 le Remic’s de la SFM  jeudi 9 décembre. de 13H à 13H30, Gastro-entérites bactériennes :

Cas pratique rencontré, avis demandé d’une pédiatre de ville au service de gastro-enterologie pédiatrique du CHU de Bordeaux

Bonsoir, J’ai vu un bébé de 15 mois pour diarrhée trainante depuis 1 mois non sanglante, sans fièvre. J’ai fait faire une copro qui montre de l’ADN détecté pour les gènes des shigatoxines. Cet enfant par ailleurs est en très bon état général. “

a – Il y a t-il un risque de SHU ?
b – Dois je le mettre sous antibiotique ou pas?
si oui, lequel?
c- Faut-il l’hospitaliser ?

https://www.sfm-microbiologie.org/evenement/webinars-hebdomadaires-de-microbiologie-clinique-le-remics/

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

 

Dernier article publié : « Adaptation of an in-house PCR for the detection of Helicobacter pylori and the mutations associated with macrolide resistance into ready-to-use PCR microwell strips »

Background and Objectives

The present study describes the successful adaptation of an in-house Polymerase Chain Reaction (PCR) for Helicobacter pylori detection coupled with the main mutations associated with resistance to clarithromycin in ready-to-use PCR microwell strips.

Materials and Methods

These microwell strips can be used on LightCycler® 480, and are delivered with nine microliters of the reaction mixture dispensed into 8-well microwell strips. An extraction control PCR targeting the β-globin household gene is amplified in the same run as H pylori detection.

Results and Conclusion

These microwell strips can be stored at −20°C for 1 year and left at room temperature and in the light for up to 4 h with no impact on the PCR results. Microwell strips can also undergo a thaw and refreeze cycle without impacting the PCR results. These PCR microwell strips are available for purchase from Eurogentec.

 

-> Pour la lecture de l’article : Adaptation of an in-house-PCR for the detection of Helicobacter pylori and the mutations associated with macrolide resistance into ready-to-use PCR microwell strips

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

 

3- Article  : « Épidémiologie de l’infection à Helicobacter pylori en France en 2020 : données de surveillance du CNR Campylobacters et Hélicobacters » – Epidemiology of Helicobacter pylori infection in France in 2020: Surveillance data from the National Reference Centre for Campylobacters and Helicobacters

Helicobacter pylori | diagnostic | résistance aux antibiotiques

Résumé : Le Centre national de référence des Campylobacters et des Hélicobacters (CNRCH) travaille avec un réseau de correspondants locaux et nationaux. L’activité H. pylori au CNRCH a poursuivi sa progression en 2020 grâce en particulier au recrutement de nouveaux correspondants. L’année 2020 confirme la stabilisation de la résistance primaire aux macrolides et aux fluoroquinolones. De rares souches résistantes à l’amoxicilline ou à la rifampicine ont été identifiées en 2020. Nos données démontrent l’intérêt d’associer la recherche par culture de cette infection à une détection moléculaire de la bactérie et des mutations associées à la résistance aux macrolides. Notre participation à un protocole de surveillance français et à un réseau de surveillance européen nous permet de comparer nos données internes au CNR avec des données obtenues sur le territoire national et européen. L’année 2020 a été marquée par une forte adhésion de nos correspondants à nous fournir des renseignements cliniques associés à l’envoi de biopsies gastriques.

-> Pour la lecture de l’article : Bulletin épidémiologique hebdomadaire Santé Publique France

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

4- Le CNR Campylobacters-Hélicobacters organise pour vous  un séminaire on-line du jeudi 18 novembre 2021  :

 « Nouveautés cliniques et d’antibiorésistance dans le monde des Campylobacters »

Nos collègues Claire Tinevez (CHU de Bordeaux) et Isabelle Kempf  (Anses, LNR Antibiorésistance, unité MBA, laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort) vous préparent de superbes diaporamas didactiques sur les thèmes suivants :

∠ Evaluation des facteurs pronostics de mortalité précoce des bactériémies à Campylobacter

∠ Antibiorésistance de Campylobacter en filières volailles et porcine : comparatif avec les chiffres du CNRCH.

Nous mettons à votre disposition les deux présentations faites le 18.11.2021 : cliquez sur les liens suivant.

-> C Tinévez seminaire on line 18.11.21

->  I Kempf seminaire on line 18.11.21

 

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

5-  Journée d’information et d’échanges –  Campylobacter.

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

6- Merci aux professionnels pour votre participation au séminaire en ligne du 06 mai 2021 organisé par le CNRCH.

Pour ceux qui n’ont pas pu nous rejoindre, ci-dessous les deux liens pour visualiser et partager les présentations.

 

Vous pouvez nous suggérer des thématiques pour les prochains séminaires. Voici notre email : cnrch@chu-bordeaux.fr

 

∴∴∴∴∴∴∴∴∴∴

 

7- Présentation de Quentin Jehanne, ingénieur d’études hospitalier au CNRCH.

Dans le contexte de sa thèse en cours, Quentin a développé une méthodologie d’attribution de sources basée sur des mutations dans le génome de C. coli.

Nous remercions tous nos correspondants pour leurs envois de souches. C’est grâce à votre participation active au réseau de surveillance que ce type d’étude peut être réalisée.

 

 

Genome-wide identification of Host-Segregating Single-Nucleotide Polymorphisms for Source Attribution of clinical Campylobacter coli Isolates

Quentin Jehanne, Ben Pascoe, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Alice Buissonnière, Evangelos Mourkas, Francis Mégraud, Emilie Bessède, Samuel K Sheppard, Philippe Lehours. Applied and Environmental Microbiology Oct 2020, AEM.01787-20; DOI: 10.1128/AEM.01787-20

 

 

 



Nomination du CNRCH 2017-2021 :

Le Laboratoire de Bactériologie de l’Hôpital des Enfants de Bordeaux a été l’un des premiers en France à s’intéresser aux Campylobacters en 1979. Durant les années 80, nous avons mené plusieurs études sur le rôle des Campylobacters dans les diarrhées de l’enfant dans les pays en développement, soutenues par : l’OMS (Vietnam), la Communauté Européenne (Burkina Faso) et le Ministère français des Affaires Etrangères (Algérie).

En France, nous avons mis en place un réseau hospitalier de surveillance des infections à Campylobacter avec l’aide du Groupe d’Etudes Epidémiologiques et Prophylactiques (GEEP). Ce réseau soutenu par le Ministère de la Santé dès 1986 a permis d’obtenir les premières données épidémiologiques sur cette infection dans notre pays, et notre laboratoire est devenu Centre National de Référence en 1993, renouvelé en 1998, 2002 et 2006. En 2002, le système de surveillance a été étendu aux laboratoires de ville.

Helicobacter pylori
a été découvert en 1982, et classé initialement dans le genre Campylobacter. Pour cette raison, nous avons été amenés à étudier cette bactérie qui avait une niche écologique différente de celle des autres Campylobacters. C’est seulement en 1989 qu’un nouveau genre a été créé pour cette bactérie avec comme espèce principale H. pylori.

Le CNRCH a été créé en 1993 et est passé sous gestion du CHU de Bordeaux depuis 2017 pour la période 2017-2022.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 campylobacter, campylobacter, helicobacter, antibiotique, surveillance, traitements, épidémiologie, conseils, avis, antibiotiques, éradications, antibiotiques, conseil, centre, bordeaux,référence, souche, souches, campylobacter, helicobacter, avis, conseils, suivi, surveillance, équipe, CHU Bordeaux, campylobacter, hélicobacter, infection, infections, épidémiologie, conseils et traitement, antibiotique

campylobacter, helicobacter, reference, bordeaux, Bordeaux,cnr, france, antibiotiques, réseau, surveillance, souche, centre, campylobacter, hélicobacter, reference, bordeaux, cnr, france, réseau, surveillance, souche, centre, traitement, conseils, conseil, éradication, antibiotiques, analyse, résistance, épidémiologie, cnr, centre, bordeaux, conseils, traitement, campylobacter, bordeaux, équipe, surveillance, résistance, traitements analyses, laboratoire, antibiotiques, référence, surveillance, veille, analyse, ATB, réseau, antibiotiques, centre, traitement, conseils, avis, helicobacter, france, bordeaux, bordeaux, réseau, surveillance, traitement, infections, campylobacter, campylobacter, résistance, traitements, campylobacter, hélicobacter, bordeaux, centre, antibiotique,