Le LNR Campylobacter et le CNR des Campylobacters et Helicobacters,

sous le parrainage de la SFM, ont le plaisir de vous inviter à participer à

la Journée d’Informations et d’Echanges sur Campylobacter

le 12 Octobre 2021  de 13h30 à 17h30  en distanciel par Teams

Vous trouverez, ci-joint, le programme détaillé de la journée. L’inscription est gratuite mais obligatoire via le lien hypertexte suivant :

https://survey.anses.fr/v4/s/ddim2p

Les inscriptions seront clôturées au lundi 27/09/2021.

Les modalités de connexion vous seront communiquées quelques jours précédant la journée.

 

Programme de la journée : Programme JT Campylobacter 2021

Nous restons à votre disposition pour tout renseignement complémentaire.

Au plaisir de vous retrouver virtuellement,

Le LNR Campylobacter (Anses) & le CNR des Campylobacters et Helicobacters (CHU Bordeaux)

 



Le rapport des activités du CNRCH de l’année 2020 est disponible :  Cliquez sur ce lien pour accéder au rapport : Rapport CNRCH 2021 VA

 



Pratique !

Catalogue des actes -> choisir l’onglet « Catalogue des actes » puis sélectionner votre demande dans le menu déroulant. Les process d’envoi y sont également expliqués.

Contact -> choisir cet onglet pour transmettre aux biologistes du CNRCH vos demandes : conseils thérapeutiques, techniques etc…

Numéro direct et secrétariat :05 56 79 59 77



Nouvel article publié dans American Society of Microbiology.

Emergence de méthyltransférases résistantes à l’érythromycine dans des souches de Campylobacter coli en France

Abstract : Antimicrobial resistance in Campylobacters is described worldwide. The emergence of multiresistant isolates, particularly among C. coli, is concerning. New resistance mechanisms appear frequently, and DNA-sequence-based methods such as whole genome sequencing (WGS) have become useful tools to monitor their emergence. The genomes of 51 multiresistant French Campylobacter sp. clinical strains from 2018 to 2019 were analyzed to identify associated resistance mechanisms. Analyses of erythromycin-resistant strains revealed 23S ribosomal RNA mutations among most of them and two different methyltransferases in 4 strains: Erm(B) and a novel methyltransferase, here named Erm(N). The erm(B) gene was found in multidrug-resistant genomic islands, whereas erm(N) was inserted within CRISPR arrays of the CRISPR-cas9 operon. Moreover, using PCR screening in erythromycin-resistant strains from our collection, we showed that erm(N) was already present in 3 French clinical strains 2 years before its first report in 2018 in Quebec. Bacterial transformations confirmed that insertion of erm(N) into a CRISPR-cas9 operon can confer macrolide resistance. Campylobacter species are easily able to adapt to their environment and acquire new resistance mechanisms, and the emergence of methyltransferases in Campylobacters in France is a matter of concern in the coming years.

Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau1, Chloé Domingues-Martins, Théo Cousinou, Emilie Bessède, Philippe Lehours

 



Merci aux professionnels pour votre participation au premier séminaire en ligne du 06 mai 2021 organisé par le CNRCH.

Pour ceux qui n’ont pas pu nous rejoindre, ci-dessous les deux liens pour visualiser et partager les présentations.

 

Vous pouvez nous suggérer des thématiques pour les prochains séminaires. Voici notre email : cnrch@chu-bordeaux.fr

 



Le CNRCH 2.0 : une nouvelle « pipeline » d’analyses bio-informatiques.

Le séquençage génomique et la bio-informatique : des outils utiles pour caractériser de nouvelles espèces de Campylobacters et Hélicobacters.

Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Chloé Domigues-Martins, Emilie Bessède, Philippe Lehours.

 



 

Nouvelle répartition, par départements, des souches campylobacters reçues au CNRCH en 2020.

 

carte de France – répartition des souches campylobacters 2020

 

 


Présentation de Quentin Jehanne, ingénieur d’études hospitalier au CNRCH.

Dans le contexte de sa thèse en cours, Quentin a développé une méthodologie d’attribution de sources basée sur des mutations dans le génome de C. coli.

Nous remercions tous nos correspondants pour leurs envois de souches. C’est grâce à votre participation active au réseau de surveillance que ce type d’étude peut être réalisée.

 

 

Genome-wide identification of Host-Segregating Single-Nucleotide Polymorphisms for Source Attribution of clinical Campylobacter coli Isolates

Quentin Jehanne, Ben Pascoe, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Alice Buissonnière, Evangelos Mourkas, Francis Mégraud, Emilie Bessède, Samuel K Sheppard, Philippe Lehours. Applied and Environmental Microbiology Oct 2020, AEM.01787-20; DOI: 10.1128/AEM.01787-20

 



Essentiels :

Campylobacters : Nos missions d’expertises et de contribution à la surveillance

Helicobacter pylori : Nos missions d’expertises et de contribution à la surveilllance

 



Nomination du CNRCH 2017-2021 :

Le Laboratoire de Bactériologie de l’Hôpital des Enfants de Bordeaux a été l’un des premiers en France à s’intéresser aux Campylobacters en 1979. Durant les années 80, nous avons mené plusieurs études sur le rôle des Campylobacters dans les diarrhées de l’enfant dans les pays en développement, soutenues par : l’OMS (Vietnam), la Communauté Européenne (Burkina Faso) et le Ministère français des Affaires Etrangères (Algérie).

En France, nous avons mis en place un réseau hospitalier de surveillance des infections à Campylobacter avec l’aide du Groupe d’Etudes Epidémiologiques et Prophylactiques (GEEP). Ce réseau soutenu par le Ministère de la Santé dès 1986 a permis d’obtenir les premières données épidémiologiques sur cette infection dans notre pays, et notre laboratoire est devenu Centre National de Référence en 1993, renouvelé en 1998, 2002 et 2006. En 2002, le système de surveillance a été étendu aux laboratoires de ville.

Helicobacter pylori
a été découvert en 1982, et classé initialement dans le genre Campylobacter. Pour cette raison, nous avons été amenés à étudier cette bactérie qui avait une niche écologique différente de celle des autres Campylobacters. C’est seulement en 1989 qu’un nouveau genre a été créé pour cette bactérie avec comme espèce principale H. pylori.

Le CNRCH a été créé en 1993 et est passé sous gestion du CHU de Bordeaux depuis 2017 pour la période 2017-2022.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


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