-> SFM, Campylobacter Release in december 2022 avec notre participation à l’écriture du livre sur trois chapitres.

https://www.sfm-microbiologie.org/boutique/campylobacter-2022/

 

 

-> Article du jle, Hépato-Gastro, 2022, Volume 29, Numéro 8 :

Exploration microbiologiques de la sensibilité aux antibiotiques de Helicobacter pylori. Pr Philippe Lehours.

Résumé : Létude de la sensibilité de Helicobacter pylori aux antibiotiques repose sur lisolement par culture de la bactérie à partir de biopsies gastriques. Les antibiogrammes sont réalisés par détermination des concentrations minimales inhibitrices en testant au minimum la clarithromycine et la lévofloxacine.
L
alternative à la culture est de chercher au minimum par PCR les mutations associées à la résistance aux macrolides. Les PCR sur échantillons de selles ne sont pas encore au point.

Pour sa lecture intégrale : –> explorations microbiologiques de la sensibilité aux antibiotiques de Helicobacter pylori – jle – Hepato-gastro oncologie – PL

 

-> Les demandes de sérologie Campylobacter jejuni doivent être accompagnées d’une fiche de renseignements cliniques téléchargeable sur notre site internet.

Pour télécharger ce document, vous rendre dans l’onglet :

« Catalogue des actes » -> « campylobacter (sérologie) » ->« formulaire requis »

En l’absence de cette feuille, la sérologie ne sera pas effectuée.

Merci pour votre collaboration.

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Dernier article publié : « Nouvelles valeurs moléculaires pour les tests de sensibilité aux antibiotiques pour Aliarcobacter butzleri » à lire dans notre onglet  « Bilans et Publications » Molecular Cut-off Values for Aliarcobacter butzleri Susceptibility Testing 

 

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Les sociétés I2A et Biomérieux commercialisent des bandelettes contenant de l’amoxicilline + une concentration fixe d’acide clavulanique à 2mg/L.

Les valeurs de CMI obtenues sur la souche de CQ pour C. jejuni sont impactées.

Les bornes proposées dans les recommandations du CASFM ne sont plus valables pour cette nouvelle génération de bandelettes.

Ouvrir le lien suivant : CMI AUG comparaison Biomerieux I2A

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Recommandations du CASFM 2022 pour Campylobacter et Helicobacter pylori

-> Vous pouvez télécharger le document dans l’onglet « FICHES TECHNIQUES et RECOMMANDATIONS »

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Séminaire on-line le 29 juin 2022 :

-Mme Fanny Chéreau, Santé Publique France : « Bilan 2017-2021 de l’épidémiologie des infections à Campylobacters en France ».

cliquer sur le lien ci-après pour la lecture du document ->  Présentation de F Chereau Santé Publique France

 

-Mme Lucie Bruhl, ingénieur au CNRCH:  « Automatisation sur BDMAX et Ingenius d’une PCR commerciale pour la détection de Helicobacter pylori ».

cliquer sur le lien ci-après pour la lecture du document -> Lucie B séminaire CNR juin 2022

 

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CNR des Campylobacters & Hélicobacters : Préparation des antibiogrammes campylobacter – ensemencement Helicobacter pylori

 Photos : Guillaume Ferran – CHU Bordeaux

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Répartition par départements des souches campylobacters reçues au CNRCH en 2021 et déclarées en ligne par le réseau Campy-internet.

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Webinars hebdomadaires de Microbiologie Clinique

Cas pratique rencontré, avis demandé d’une pédiatre de ville au service de gastro-enterologie pédiatrique du CHU de Bordeaux

Bonsoir, J’ai vu un bébé de 15 mois pour diarrhée trainante depuis 1 mois non sanglante, sans fièvre. J’ai fait faire une copro qui montre de l’ADN détecté pour les gènes des shigatoxines. Cet enfant par ailleurs est en très bon état général. “

a – Il y a t-il un risque de SHU ?
b – Dois je le mettre sous antibiotique ou pas?
si oui, lequel?
c- Faut-il l’hospitaliser ?

https://www.sfm-microbiologie.org/evenement/webinars-hebdomadaires-de-microbiologie-clinique-le-remics/

 

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Article : « Adaptation of an in-house PCR for the detection of Helicobacter pylori and the mutations associated with macrolide resistance into ready-to-use PCR microwell strips »

Background and Objectives

The present study describes the successful adaptation of an in-house Polymerase Chain Reaction (PCR) for Helicobacter pylori detection coupled with the main mutations associated with resistance to clarithromycin in ready-to-use PCR microwell strips.

Materials and Methods

These microwell strips can be used on LightCycler® 480, and are delivered with nine microliters of the reaction mixture dispensed into 8-well microwell strips. An extraction control PCR targeting the β-globin household gene is amplified in the same run as H pylori detection.

Results and Conclusion

These microwell strips can be stored at −20°C for 1 year and left at room temperature and in the light for up to 4 h with no impact on the PCR results. Microwell strips can also undergo a thaw and refreeze cycle without impacting the PCR results. These PCR microwell strips are available for purchase from Eurogentec.

 

-> Pour la lecture de l’article : Adaptation of an in-house-PCR for the detection of Helicobacter pylori and the mutations associated with macrolide resistance into ready-to-use PCR microwell strips

 

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 Article  : « Épidémiologie de l’infection à Helicobacter pylori en France en 2020 : données de surveillance du CNR Campylobacters et Hélicobacters » – Epidemiology of Helicobacter pylori infection in France in 2020: Surveillance data from the National Reference Centre for Campylobacters and Helicobacters

Helicobacter pylori | diagnostic | résistance aux antibiotiques

Résumé : Le Centre national de référence des Campylobacters et des Hélicobacters (CNRCH) travaille avec un réseau de correspondants locaux et nationaux. L’activité H. pylori au CNRCH a poursuivi sa progression en 2020 grâce en particulier au recrutement de nouveaux correspondants. L’année 2020 confirme la stabilisation de la résistance primaire aux macrolides et aux fluoroquinolones. De rares souches résistantes à l’amoxicilline ou à la rifampicine ont été identifiées en 2020. Nos données démontrent l’intérêt d’associer la recherche par culture de cette infection à une détection moléculaire de la bactérie et des mutations associées à la résistance aux macrolides. Notre participation à un protocole de surveillance français et à un réseau de surveillance européen nous permet de comparer nos données internes au CNR avec des données obtenues sur le territoire national et européen. L’année 2020 a été marquée par une forte adhésion de nos correspondants à nous fournir des renseignements cliniques associés à l’envoi de biopsies gastriques.

-> Pour la lecture de l’article : Bulletin épidémiologique hebdomadaire Santé Publique France

 

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Le CNR Campylobacters-Hélicobacters (séminaire on-line) :

 « Nouveautés cliniques et d’antibiorésistance dans le monde des Campylobacters »

Nos collègues Claire Tinevez (CHU de Bordeaux) et Isabelle Kempf  (Anses, LNR Antibiorésistance, unité MBA, laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort) vous préparent de superbes diaporamas didactiques sur les thèmes suivants :

∠ Evaluation des facteurs pronostics de mortalité précoce des bactériémies à Campylobacter

∠ Antibiorésistance de Campylobacter en filières volailles et porcine : comparatif avec les chiffres du CNRCH.

Nous mettons à votre disposition les deux présentations faites le 18.11.2021 : cliquez sur les liens suivant.

-> C Tinévez seminaire on line 18.11.21

->  I Kempf seminaire on line 18.11.21

 

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Présentation de Quentin Jehanne, ingénieur d’études hospitalier au CNRCH.

Dans le contexte de sa thèse en cours, Quentin a développé une méthodologie d’attribution de sources basée sur des mutations dans le génome de C. coli.

Nous remercions tous nos correspondants pour leurs envois de souches. C’est grâce à votre participation active au réseau de surveillance que ce type d’étude peut être réalisée.

 

 

Genome-wide identification of Host-Segregating Single-Nucleotide Polymorphisms for Source Attribution of clinical Campylobacter coli Isolates

Quentin Jehanne, Ben Pascoe, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Alice Buissonnière, Evangelos Mourkas, Francis Mégraud, Emilie Bessède, Samuel K Sheppard, Philippe Lehours. Applied and Environmental Microbiology Oct 2020, AEM.01787-20; DOI: 10.1128/AEM.01787-20

 

 

 



Nomination du CNRCH 2017-2021 :

Le Laboratoire de Bactériologie de l’Hôpital des Enfants de Bordeaux a été l’un des premiers en France à s’intéresser aux Campylobacters en 1979. Durant les années 80, nous avons mené plusieurs études sur le rôle des Campylobacters dans les diarrhées de l’enfant dans les pays en développement, soutenues par : l’OMS (Vietnam), la Communauté Européenne (Burkina Faso) et le Ministère français des Affaires Etrangères (Algérie).

En France, nous avons mis en place un réseau hospitalier de surveillance des infections à Campylobacter avec l’aide du Groupe d’Etudes Epidémiologiques et Prophylactiques (GEEP). Ce réseau soutenu par le Ministère de la Santé dès 1986 a permis d’obtenir les premières données épidémiologiques sur cette infection dans notre pays, et notre laboratoire est devenu Centre National de Référence en 1993, renouvelé en 1998, 2002 et 2006. En 2002, le système de surveillance a été étendu aux laboratoires de ville.

Helicobacter pylori
a été découvert en 1982, et classé initialement dans le genre Campylobacter. Pour cette raison, nous avons été amenés à étudier cette bactérie qui avait une niche écologique différente de celle des autres Campylobacters. C’est seulement en 1989 qu’un nouveau genre a été créé pour cette bactérie avec comme espèce principale H. pylori.

Le CNRCH a été créé en 1993 et est passé sous gestion du CHU de Bordeaux depuis 2017 pour la période 2017-2022.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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