Publications

Elles regroupent également les travaux de recherche effectués au laboratoire INSERM U1053 « Infection à Hélicobacter, Inflammation et Cancer », adossé au CNR.

2025

• gillet-et-al-2025-resistome-and-virulome-determination-in-helicobacter-pylori-using-next-generation-sequencing-with

American Society for Microbiology : Détermination du résistome et du virulome chez Helicobacter pylori par NGS et préparation de librairies d’enrichissement de cibles

Gillet Léo, Bénéjat Lucie, Jehanne Quentin, Maunet Pierre-Louis, Perreau Claudie, Ducournau Astrid, Aptel Johanna, Jauvain Marine, Philippe Lehours.

 

• Gut Pathog 2025. Détection d’antigènes de campylobacter dans les échantillons de selles.

Gut Pathogens dans BMC : Évaluation d’un essai immunologique rapide par fluorescence pour la détection d’antigènes de campylobacter dans des échantillons de selles.

Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Juliette Gebhart, Emilie Bessede, Juergen Becker, Marine Jauvain, Philippe Lehours.

2024

• 2024_jehanne-et-al-2024-increasing-rates-of-erm(b)-and-erm(n)-in-human-campylobacter-coli-and-campylobacter-jejuni  :

Increasing rates of erm(B) and erm(N) in human Campylobacter coli and Campylobacter jejuni erythromycin-resistant isolates between 2018 and 2023 in France. American Society for Microbiology.

Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Johanna Aptel, Marie Pivard, Léo Gillet, Marine Jauvain, Philippe Lehours.

 

• 2025 Sahel Wandji First two human infections with Helicobacter zhangjianzhongii, a new Helicobacter closely related to Helicobacter canis

Sahel Wandji, Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Johanna Aptel, Marion Levast, Marine Jauvain, Philippe Lehours.

2023

• P.Lehours. Infections à Campylobacter. EMC – Biologie médicale 20231-10

EMC Biologie médicale. P. Lehours

Résumé : L’infection à Campylobacter est la première cause d’infection entérique bactérienne. Elle est surtout liée à C. jejuni et C. coli. Cette infection est une zoonose dont le réservoir est constitué essentiellement par les oiseaux, transmise par les aliments, en particulier la volaille. Il s’agit en général de cas sporadiques. L’infection correspond le plus souvent à une colite inflammatoire. Le syndrome de l’intestin irritable apparaît aussi être une conséquence de l’infection à Campylobacter. Le diagnostic historiquement réalisé par culture à partir de selles est dorénavant devancé par les approches moléculaires ditessyndromiques. Lesformessepticémiques concernentsurtout les espèces C. fetus et C. jejuni. Parmi les complications postinfectieuses, la plus sévère est le syndrome de Guillain-Barré. Le traitement antibiotique n’est pas conseillé dans tous les cas d’infection digestive mais seulement dans les formes les plus graves et aux âges extrêmes de la vie, aux femmes enceintes et aux immunodéprimés. Il doit être systématique et bactéricide dans les infections invasives.

 

• Diagnostic and treatment aspects of Helicobacter pylori infection – Journal de Biologie Médicale

Journal de Biologie Médicale / Volume 12-Numéro 47 / Oct-Déc 2023, P. Lehours

Résumé : L’infection par la bactérie Helicobacter pylori a été découverte par deux chercheurs australiens au milieu des années 1980 grâce à la culture sur milieu gélosé à partir de biopsies gastriques. Cette culture reste de nos jours délicate à mettre en place. Aussi, de nombreux tests diagnostiques directs ou indirects alternatifs ont été proposés afin d’accéder à ce diagnostic. Des schémas d’éradication ont été très rapidement proposés mais faute de pouvoir accéder au profil de sensibilité de la bactérie, les traitements probabilistes ont été très largement plébiscités. Le développement de la PCR en temps réel permet de nos jours d’orienter le traitement d’éradication vers des traitements ciblés notamment sur le profil de sensibilité à une molécule clé du traitement, la clarithromycine.

 

• 2023_ Deforet – Mécanisme Résistance Amox-acide clav  :  Approche combinée génomique-protéomique dans l’identification du mécanisme de résistance de l’amoxicilline et de l’acide clavulanique de Campylobacter coli dans des isolats cliniques.

Francis Deforet, Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Johanna Aptel, Roxane Prat, Chloé Desbiolles, Astrid Ducournau, Marine Jauvain, Richard Bonnet, François Vandenesch, Jérôme Lemoine, Philippe Lehours.

 

• Campylobacter fetus foodborne illness outbreak in the elderly – PubMed (nih.gov)

Gaspard Grouteau, Cédric Mignonat, Bruno Marchou, Guillaume Martin-Blondel, Olivier Glass, Claire Roubaud-Baudron, Pauline Lansalot-Matras, Simon Alik, Laurent Balardy, Thomas De Nadaï, Lucie Bénéjat, Quentin Jehanne,  Alain Le Coustumier, Philippe Lehours.

 

• Recurrent Campylobacter jejuni Infections with In Vivo Selection of Resistance to Macrolides and Carbapenems: Molecular Characterization of Resistance Determinants – PubMed (nih.gov)

Alexandra Nunes, Mónica Oleastro, Frederico Alves, Nadia Liassine, David M Lowe, Lucie Benejat, Astrid Ducounau, Quentin Jehanne  Vítor Borges, João Paulo Gomes, Gauri Godbole, Lehours Philippe^.

2022

• RIDA®GENE Helicobacter pylori PCR on the ELITe InGenius System

    Lucie Bénéjat, Asrid Ducournau, Chloé Domingues Martins, Emilie Bessède, Philippe Lehours

 

• Bacteremia in France: The Campylobacteremia Study -Tinevez 2022

Étude rétrospective multicentrique sur Campylobacter spp. Bactériémie en France : l’étude sur la campylobactériémie

Tinévez C, Velardo F, Ranc AG, Dubois D, Pailhoriès H, Codde C, Join-Lambert O, Gras E, Corvec S, Neuwirth C, Melenotte C, Dorel M, Lagneaux AS, Pichon M, Doat V, Fournier D, Lemaignen A, Bouard L, Patoz P, Hery-Arnaud G, Lemaitre N, Couzigou C, Guillard T, Recalt E, Bille E, Belaroussi Y, Neau D, Cazanave C, Lehours P, Puges M; Campylobacteremia study group. Clin Infect Dis. 2022 Sep 10;75(4):702-709. doi: 10.1093/cid/ciab983. PMID: 34849656

 

• https://www.sfm-microbiologie.org/boutique/campylobacter-2022/

 

• Explorations microbiologiques de la sensibilité aux antibiotiques de Helicobacter pylori – jle – Hepato-gastro oncologie – PL

Philippe Lehours

 

•  Molecular Cut-off Values for Aliarcobacter butzleri Susceptibility Testing

Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat-Bruhl, Astrid Ducournau, Emilie Bessède, Philippe Lehours

 

2021

 

• Bulletin épidémiologique hebdomadaire Santé Publique France

  Épidémiologie de l’infection à Helicobacter pylori en France en 2020 : données de surveillance du CNR Campylobacters et Hélicobacters » – Epidemiology of Helicobacter pylori infection in France in 2020: Surveillance data from the National Reference Centre for Campylobacters and Helicobacters

Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau, Chloé Domingues Martins, Quentin Jehanne, Francis Mégraud, Alice Blosse, Émilie Bessède, Philippe Lehours
Centre national de référence des Campylobacters et des Hélicobacters, CHU Pellegrin, Bordeaux
Univ. Bordeaux, Inserm, UMR1053 Bordeaux Research in Translational Oncology, BaRITOn, Bordeaux

Quentin Jehanne, Lucie Bénéjat, Astrid Ducournau1, Chloé Domingues-Martins, Théo Cousinou, Emilie Bessède, Philippe Lehours

2020

• Whole-Genome Sequencing and Bioinformatics as Pertinent Tools to Support Helicobacteracae Taxonomy, Based on Three Strains Suspected to Belong to Novel Helicobacter Species

Berthenet E, Bénéjat L, Ménard A, Varon C, Lacomme S, Gontier E, Raymond J, Boussaba O, Toulza O, Ducourau A, Buissonnière A, Giese A, Megraud F, Bessède E, Jehanne Q, Lehours P.

 

• Genome-wide identification of Host-Segregating Single-Nucleotide Polymorphisms for Source Attribution of clinical Campylobacter coli Isolates

Jehanne Q, Pascaoe B, Bruhl L, Ducournau A, Buissonnière A, Mourkas E, Mégraud F, Bessède E,  Sheppard Samuel K, Lehours P.

 

• Survey of the antimicrobial resistance of Helicobacter pylori in France in 2018 and Evolution during the previous 5 years

• Performance evaluation of the Novodiag® Bacterial GE+ multiplex PCR assay.

Roy C, Robert D, Bruhl L, Buissonnière A, Ducournau A, Mégraud F, Bessède E, Boraud D, Lehours P. J Clin Microbiol. 2020 Jul 22:JCM.01033-20. doi: 10.1128/JCM.01033-20. Online ahead of print. PMID: 32719031

 

• Alzheimer’s Disease and Helicobacter pylori Infection: Inflammation from Stomach to Brain?

Albaret G, Sifré E, Floch P, Laye S, Aubert A, Dubus P, Azzi-Martin L, Giese A, Salles N, Mégraud F, Varon C, Lehours P, Roubaud-Baudron C. J Alzheimers Dis. 2020;73(2):801-809. doi: 10.3233/JAD-190496. PMID: 31868664

 

• Review – Helicobacter, inflammation, immunology and vaccines.

Robinson K, Lehours P. Helicobacter. 2020 Sep;25 Suppl 1:e12737. doi: 10.1111/hel.12737. PMID: 32918349

 

• Evaluation of RIDASCREEN® and RIDA®QUICK Helicobacter kits for Helicobacter pylori detection in stools

Bénéjat L, Buissonnière A, Ducournau A, Mégraud F, Bessède E, Lehours P. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2020 Jun 10. doi: 10.1007/s10096-020-03943-3. Online ahead of print. PMID: 32519216

 

• Evaluation of the Allplex™ H pylori and ClariR PCR Assay for Helicobacter pylori detection on gastric biopsies.

Jehanne Q, Bénéjat L, Mégraud F, Bessède E, Lehours P. Helicobacter. 2020 May 19:e12702. doi: 10.1111/hel.12702. Online ahead of print. PMID: 32426894

 

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2019

• Campylobacter armoricus sp. nov., a novel member of the Campylobacter lari group isolated from surface water and stools from humans with enteric infection.

Boukerb AM, Penny C, Serghine J, Walczak C, Cauchie HM, Miller WG, Losch S, Ragimbeau C, Mossong J, Mégraud F, Lehours P, Bénéjat L, Gourmelon M.Int J Syst Evol Microbiol. 2019 Nov 12. doi: 10.1099/ijsem.0.003836. [Epub ahead of print] PMID: 31714200

 

• Real-time PCR detection of a 16S rRNA single mutation of Helicobacter pylori isolates associated with reduced susceptibility and resistance to tetracycline in the gastroesophageal mucosa of individual hosts.

Contreras M, Benejat L, Mujica H, Peña J, García-Amado MA, Michelangeli F, Lehours P.

J Med Microbiol. 2019 Sep;68(9):1287-1291. doi: 10.1099/jmm.0.001051. PMID: 31364966

 

• Rapid Characterization of Virulence Determinants in Helicobacter pylori Isolated from Non-Atrophic Gastritis Patients by Next-Generation Sequencing.

Imkamp F, Lauener FN, Pohl D, Lehours P, Vale FF, Jehanne Q, Zbinden R, Keller PM, Wagner K.

J Clin Med. 2019 Jul 12;8(7). pii: E1030. doi: 10.3390/jcm8071030.

 

• Source attribution of Campylobacter jejuni shows variable importance of chicken and ruminants reservoirs in non-invasive and invasive French clinical isolates.

Berthenet E, Thépault A, Chemaly M, Rivoal K, Ducournau A, Buissonnière A, Bénéjat L, Bessède E, Mégraud F, Sheppard SK, Lehours P.

Sci Rep. 2019 May 30;9(1):8098. doi: 10.1038/s41598-019-44454-2.

 

• Genetic Determinants and Prediction of Antibiotic Resistance Phenotypes in Helicobacter pylori.

Lauener FN, Imkamp F, Lehours P, Buissonnière A, Benejat L, Zbinden R, Keller PM, Wagner K.

J Clin Med. 2019 Jan 7;8(1). pii: E53. doi: 10.3390/jcm8010053.

 

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2018

• Different latent class models were used and evaluated for assessing the accuracy of campylobacter diagnostic tests: overcoming imperfect reference standards?

Asselineau J, Paye A, Bessède E, Perez P, Proust-Lima C.  Epidemiol Infect. 2018 Sep;146(12):1556-1564. doi: 10.1017/S0950268818001723. Epub 2018 Jun 27. PMID : 29945689.

 

• A representative overview of the genetic diversity and lipooligosaccharide sialylation in Campylobacter jejuni along the broiler production chain in France and its comparison with human isolates.

Thépault, A., Guyard-Nicodème, M., Rose, V., Quesne, S., Queguiner, M., Houard, E., Mégraud, F., Rivoal, K., Chemaly, M.  Int J Food Microbiol. 2018;274:20-30.

 

• Molecular detection of mutations involved in Helicobacter pylori antibiotic resistance in Algeria

Bachir, M., Allem, R., Benejat, L., Tifrit, A., Medjekane, M., Drici, AE., Mégraud, F., Douidi, K.T. . J Antimicrob Chemother. 2018;73:2034-2038.

 

• Campylobacter infection in adult patients with primary antibody deficiency.

Dion, J., Bénéjat, L., Mégraud, F., Wargnier, A., Boutboul, D., Galicier, L., Le Moing, V., Giraud, P., Jaccard, A., Nove-Josserand, R., Fieschi, C., Oksenhendler, E., Gérard, L., DEFI study group.  J Allergy Clin Immunol Pract. 2018 Jul 6. pii: S2213-2198(18)30415-X. doi: 10.1016/j.jaip.2018.06.014. [Epub ahead of print].

 

• Relating Phage Genomes to Helicobacter pylori Population Structure: General Steps Using Whole-Genome Sequencing Data.

Int J Mol Sci. 2018 Jun 21;19(7). pii: E1831. doi: 10.3390/ijms19071831. Vale FF, Lehours P.

 

• Helicobacter: Inflammation, immunology, and vaccines. Helicobacter

Blosse A, Lehours P, Wilson KT, Gobert AP. . 2018 Sep;23 Suppl 1:e12517. doi: 10.1111/hel.12517. Review.

 

•  Actual diagnosis of Helicobacter pylori infection. Minerva Gastroenterol Dietol.

Lehours P.2018 Apr 12. doi: 10.23736/S1121-421X.18.02494-7. [Epub ahead of print]

 

• European Registry on the management of Helicobacter pylori infection (Hp-EuReg): analysis of 2360 patients receiving first-line therapy in Russia

Bordin DS, Embutnieks YV, Vologzhanina LG, Il’chishina TA, Voinovan IN, Sarsenbaeva AS, Alekseenko SA, Zaitsev OV, Abdulkhakov RA, Osipenko MF, Livzan MA, Tsukanov VV, Burkov SG, Bakulina NV, Dekhnich NN, Tarasova LV, Plotnikova EY, Maev IV, Kucheryavyi YA, Baryshnikova NV, Butov MA, Kolbasnikov SV, Pakhomova AL, Zhestkova TV, Baranovskii AY, Abdulkhakov SR, Ageeva EA, Lyalyukova EA, Vasyutin AV, Golubev NN, Savilova IV, Morkovkina LV, Kononova AG, Mégraud F, O’Morain C, Ramas M, Nyssen OP, McNicholl AG, Gisbert JP. . Ter Arkh – 2018 Feb 15;90(2):35-42. doi: 10.26442/terarkh201890235-42.

 

• Metformin can inhibit Helicobacter pylori growth.

Courtois S, Bénéjat L, Izotte J, Mégraud F, Varon C, Lehours P, Bessède E.  Future Microbiol. 2018 Nov 13. doi: 10.2217/fmb-2018-0184. [Epub ahead of print

 

• A Case of Recurrent Helicobacter cinaedi Prosthetic Joint Infection In An HIV-Infected Man.

J. Kedra, V. Zeller, B. Heym, P. Lehours, V. Meyssonnier, S. Lariven, Lucie Bruhl-Bénéjat, S. Marmor, JM. Ziza.  J. Bone Joint Infect. 2018 Oct 4;3(4):230-233. doi: 10.7150/jbji.28375. eCollection 2018

 

• Epidemiologic cutoff values to separate wild-type from non-wild-type Campylobacter fetus to ciprofloxacin.

Bénéjat L, Sifré E, Domingues Martins C, Ducournau A, Buissonnière A, Bessède E, Mégraud F, Lehours P –  Diagn Microbiol Infect Dis. 2018 Oct;92(2):164-167. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2018.05.012. Epub 2018 May 18.

 

• Whole-Genome Sequence Analysis of Multidrug-Resistant Campylobacter Isolates: a Focus on Aminoglycoside Resistance Determinants.

Fabre A, Oleastro M, Nunes A, Santos A, Sifré E, Ducournau A, Bénéjat L, Buissonnière A, Floch P, Mégraud F, Dubois V, Lehours P – J Clin Microbiol. 2018 Aug 27;56(9). pii: e00390-18. doi: 10.1128/JCM.00390-18. Print 2018 Sep.

 

• A new kit to detect Campylobacter species in stool specimens: the Orion GenRead Campylobacter®.

Buissonnière A, Bénéjat L, Charron P, Bessède E, Lehours P, Valdenaire G, Richer O, Mégraud F – Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2018 Aug;37(8):1585-1587. doi: 10.1007/s10096-018-3288-5. Epub 2018 Jun 3.

 

• Evaluation of the Diagnostic Accuracy of Two Immunochromatographic Tests Detecting Campylobacter in Stools and Their Role in Campylobacter Infection Diagnosis.

Bessède E, Asselineau J, Perez P, Valdenaire G, Richer O, Lehours P, Mégraud F – J Clin Microbiol. 2018 Mar 26;56(4). pii: e01567-17. doi: 10.1128/JCM.01567-17. Print 2018 Apr.

 

• A GWAS on Helicobacter pylori strains points to genetic variants associated with gastric cancer risk.

Berthenet E, Yahara K, Thorell K, Pascoe B, Meric G, Mikhail JM, Engstrand L, Enroth H, Burette A, Megraud F, Varon C, Atherton JC, Smith S, Wilkinson TS, Hitchings MD, Falush D, Sheppard SK – BMC Biol. 2018 Aug 2;16(1):84. doi: 10.1186/s12915-018-0550-3.

 

• Real-time PCR for Helicobacter pylori diagnosis. The best tools available.

Bénéjat L, Ducournau A, Lehours P, Mégraud F – Helicobacter. 2018 Oct;23(5):e12512. doi: 10.1111/hel.12512. Epub 2018 Aug 28.

 

• Diagnosis of Helicobacter pylori infection.

Skrebinska S, Mégraud F, Bessède E – Helicobacter. 2018 Sep;23 Suppl 1:e12515. doi: 10.1111/hel.12515. Review.

 

2017

• Publications 2017

2012 – 2016

• Publications 2012-2016

2011

• Publications 2011

2006 – 2010

• CNRCH – Publications Originales
• CNRCH – Publications Didactiques
• CNRCH – Chapitres et Proceedings

2002 – 2005

• CNRCH – Publications Originales
• CNRCH – Publications Didactiques
• CNRCH – Chapitres et Proceedings

 

• CNRCH – Livres édites et Revues