Helicobacter pylori (biopsies)

EXAMEN
Nom de l'examenHELICOBACTER PYLORI
(RECHERCHE PAR CULTURE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE)
Code analyseBIOHP (culture + PCR sur biopsie)
BGHPB (PCR seule sur biopsie)
BGHRES B (séquençage sur biopsie)
Intérêt cliniqueHelicobacter pylori est responsable de gastrite,
d'ulcère et de cancers gastriques :
- bacille à gram négatif incurvé ou spiralé, cultivé en atmosphère microaérobie
- identification basée sur les caractères morphologiques et biochimiques.
La culture permet d'étudier la sensibilité de la souche aux antibiotiques.
La PCR a une meilleure sensibilité que la culture : elle renseigne sur la présence de l'infection et sur la sensibilité à la clarithromycine.
Le patient doit avoir arrêté tout traitement à base d'inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) dans les 15 jours précédants le prélèvement.
Méthode analytique
  • PCR (détection H. pylori et détermination de la résistance à la clarithromycine)

  • Culture

  • Antibiogramme par CMI Clarithromycine / Lévofloxacine / Amoxicilline / Métronidazole / Tétracycline / Rifampicine

  • Séquençage SANGER pour recherche de mutation QRDR, rpoB, ADNr 23S et/ou ADNr 16S

  • Séquençage NGS sur souche du génome complet si culture positive


  • Facturation
  • PCR B100 (code acte 5237)
  • Culture B60 (code acte 5238), non facturée
  • ATB B70x6 (code acte 5279), facturé
  • Séquençage SANGER, non facturé
  • Séquençage NGS, non facturé
  • CONDITIONS DE PRELEVEMENT
    Nature du prèlèvementBiopsie gastrique (antrale et/ou fundus)
    Matériel de prélèvement et ConditionnementMilieu Portagerm Pylori (bioMérieux Réf. 42041)
    A conserver à +4°C ou -20°C selon la durée du transport
    (Cf. "Transport et conditions de conservations")
    Formulaire requisFeuille de renseignements Biopsie et Souche Helicobacter pylori
    TRANSPORT
    Transport et conditions de conservations⇒Si le délai entre le prélèvement de la biopsie et l’arrivée au CNR est <48h, la biopsie peut être transportée à +5°C.

    ⇒Si le délai entre le prélèvement de la biopsie et l’arrivée au CNR est >48h, la biopsie doit être transportée à -20°C.

    ⇒Les transports en kit Starstdet répondent à des règles plus strictes : merci de nous contacter.



    Modalités d’envoi des prélèvements pour le CNR des Campylobacters et des Hélicobacters



    Informations complémentairesMerci d’adresser vos prélèvements avec documents à l’adresse suivante :
    ACCUEIL DE BIOLOGIE CENTRALISE
    CHU Bordeaux-Pellegrin
    CNR des Campylobacters & Hélicobacters
    Laboratoire de Bactériologie
    Pr P. LEHOURS
    Place Amélie Raba-Léon
    33076 BORDEAUX Cedex
    FREQUENCE DES EXAMENS ET DELAI DE RENDU DES RESUTLATS
    Fréquence
  • Culture (ensemencement biopsie) du lundi au vendredi
  • PCR 2x/semaine
  • Délai de rendu
  • Si prélèvement négatif à HP, 3 à 7 jours
  • Si prélèvement positif à HP par culture, 10 à 15 jours pour un rendu d’ATB par CMI
  • 4 semaines pour un rendu NGS ou pour une recherche de résistances aux autres que macrolides par biologie moléculaire
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