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Helicobacter spp sur bloc FFPE

EXAMEN
Nom de l'examenHelicobacter spp sur bloc FFPE
Détection par biologie moléculaire des bactéries du genre Helicobacter sur bloc inclus en paraffine (FFPE) et détermination du résistome
Code analyseBGHPF
Intérêt cliniqueConfirmer par biologie moléculaire de l’infection par H. pylori ou par des Hélicobacters appartenant au groupe Heilmannii (H. suis, H. heilmannii, H. felis, H. cynogastricus, etc…). Evaluer la présence de mutations associées à la résistance aux antibiotiques (clarithromycine, lévofloxacine). Ces approches permettent en l’absence de possibilité de culture bactérienne de confirmer le diagnostic d’infection, de préciser l’espèce et d’orienter le traitement antibiotique.
Méthode analytique
  • PCR temps réel de détection de H. pylori et détermination de la résistance à la clarithromycine.

  • PCR point final suivie d’un séquençage Sanger pour la détermination de la résistance à la clarithromycine des Helicobacters appartenant au groupe Heilmannii et de la résistance à la lévofloxacine.

  • Sur demande explicite et motivée, analyse NGS (technique de Capture d’ADN) du résistome et du virulome de H. pylori.

    • Facturation
  • PCR B100 (code acte 5237) pour la PCR temps réel de détection de H. pylori et détermination de la résistance à la clarithromycine.
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    CONDITIONS DE PRELEVEMENTEnvoi de bloc FFPE.
    Formulaire requisFeuille de renseignement ADN Helicobacter FFPE
    TRANSPORT
    Transport et conditions de conservationTempérature ambiante, sans délai particulier.
    Informations complémentairesMerci d’adresser le matériel avec documents à l’adresse suivante :
    ACCUEIL DE BIOLOGIE CENTRALISE
    CHU Bordeaux-Pellegrin
    CNR des Campylobacters & Hélicobacters
    Laboratoire de Bactériologie
    Pr P. LEHOURS
    Place Amélie Raba-Léon
    33076 BORDEAUX Cedex
    Le CNRCH ne prend pas en charge les frais liés au désarchivage des blocs, au prêt ou à la mise à disposition des blocs FFPE.
    L’envoi des blocs doit avoir été validé en amont après concertation entre le clinicien en charge du traitement et les biologistes du CNRCH (mail : cnrch@chu-bordeaux.fr).
    FREQUENCE DES EXAMENS ET DELAI DE RENDU DES RESUTLATS
    FréquencePCR 1x tous les 15 jours.
    Délai de rendu résultats1 mois.